भारत के शीतोष्ण उत्तरी हिमालयी क्षेत्र में रेनबो ट्राउट फार्म से अलग किए गए बैक्टीरिया की एक नई प्रजाति स्यूडोमोनास ट्रुटिकोला sp. nov.

भाकृअनुप-शीतजल मात्स्यिकी अनुसंधान संस्थान, भीमताल द्वारा उत्तराखंड में एक ट्राउट फार्म से स्यूडोमोनास जीनस से संबंधित एक नई बैक्टीरियल प्रजाति को अलग किया गया है। इस प्रजाति को स्यूडोमोनास ट्रुटिकोला (trut.ti’co.la. L. n. trutta, ट्राउट; L. suff. -cola, निवासी; N.L. fem. adj. trutticola, ट्राउट पर रहने वाला) नाम दिया गया है। खास बात यह है कि 16S rRNA, rpoD, और gyrB जीन को टारगेट करने वाले यूनिवर्सल प्राइमर का उपयोग करके इस बैक्टीरिया का पता नहीं लगाया जा सका, क्योंकि कोई पीसीआर एम्प्लिकॉन प्राप्त नहीं हुआ। पहचान पूरे-जीनोम सीक्वेंसिंग (डब्ल्यूजीएस) के माध्यम से की गई।

पी. ट्रुटिकोला के ड्राफ्ट जीनोम का आकार 6,625,804 bp है जिसमें 59 mol% का G+C कंटेंट है। कई स्यूडोमोनास प्रजातियों के विपरीत, यह फ्लोरोसेंस नहीं दिखाता है। जीनोमिक विश्लेषण से 110 एंटी माइक्रोबियल रेजिस्टेंस (एएमआर) जीन तथा 595 विरुलेंस-एसोसिएटेड जीन का पता चला।

डब्ल्यूजीएस डेटा पर आधारित फाइलोजेनोमिक विश्लेषण से पता चलता है कि पी. ट्रुटिकोला जीनस के भीतर एक अलग क्लेड बनाता है, जो स्यूडोमोनास बेटिका (93%) और स्यूडोमोनास टेन्सिनिजेन्स जेडए 5.3 (89%) के साथ सबसे करीबी समानता दिखाता है। पी. ट्रुटिकोला और संबंधित प्रजातियों के बीच औसत न्यूक्लियोटाइड आइडेंटिटी (एएनआई) मान 93% प्रजाति सीमांकन सीमा से नीचे हैं, और डिजिटल डीएनए-डीएनए हाइब्रिडाइजेशन (dDDH) मान 70% से नीचे हैं, जो एक नई प्रजाति के रूप में इसकी स्थिति की पुष्टि करता है। इस बैक्टीरिया के जीनोम सीक्वेंस को GenBank (NCBI: BioProject ID PRJNA1348883; Biosample ID सबमिशन: SUB15730266) में जमा किया गया है।

टीएसए अगर प्लेट में स्यूडोमोनास ट्रुटिकोला की कॉलोनी, जब 28°C पर 48 घंटे के लिए इनक्यूबेट किया गया। तत्पश्चात पाया गया कि कॉलोनी म्यूकॉइड और पारभासी है।

स्यूडोमोनास ट्रुटिकोला का ग्राम-स्टेन, दिखाता है कि बैक्टीरिया नॉन-चेन बनाने वाला ग्राम-नेगेटिव रॉड है। 

यह खोज भाकृअनुप-सीआईसीएफआर, भीमताल के वैज्ञानिकों की एक टीम ने की, जिसमें डॉ. नीतू शाही, डॉ. कृष्णा काला, श्री सुमंता के. मल्लिक, श्री भूपेंद्र सिंह, डॉ. अमित पांडे और डॉ. सुरेश चंद्र शामिल थे।

(स्रोत: भाकृअनुप-शीतजल मात्स्यिकी अनुसंधान संस्थान, भीमताल)